هنگامی که نیروهای بیگانه با لشکری از ماشینها حمله میکنند، باقیمانده بشریت برای بقا مجبور به تکیه بر اندرویدیهای ساختهی خودشان، یعنی ۲بی آرام و ۹اس عصبی میشوند.
ربات های B2 و 9S همچنان ستارگان این انیمه هستند. دوباره شاهد اتوماتای نیر هستیم. تقريبا يک سال پس از توليد فصل اول نه چندان جالب انيمه نير، سرانجام فصل دوم این انیمه منتشر شده است. آهنگ پاياني گروه جمز کمپانی دوست داشتنی است. حالا سال 5012 پس از ميلاد است. موجودات فضايي به طور ناگهاني از فضا وارد شده و تهاجم خود به زمين را آغاز کردهاند. بشريت به کره ماه پناهنده شده و نبرد طولانی مدت بين ماشين هاي حياتي و اندرويدها را بر روي زمين باقي گذاشته است.
در سال 11945 پس از ميلاد، مأموريت فرود ۲۴۳ام آغاز ميشود. از آن زمان به بعد، اعضاي واحد YoRHa يعني ۲بي و ۹اس در مأموريتهايي براي بازپس گيري کره زمين شرکت داشتهاند. طي مأموريتي در نزديکي خرابههاي يک شهر، درخواستي از مقاومت براي جستجوي يک اندرويد گمشده ميرسد. این دو ربات با در نظر گرفتن این پیام، جستجو براي واحد گمشده را آغاز ميکنند.
مسیر C هیجان انگیز تر از مسیر A بود و حالا باید ببینیم اوضاع به چه شکل پیش می رود.
نحوه معرفی یوراه های نوع E و ارتباط آن با E2 جالب است، و عناصری در این فصل وجود دارد که در بخش اول معرفی نشدند. بازگشت این انیمه با اکشن بی نظیر و گرافیکی آن می تواند در این فصل انتظارات واقعی که از این انیمه می رود را برآورده کند و ضعف های بخش پیشین را جبران کند. شخصیت های B2 و S9 و A2 و امیل و پاسکال بهمراه دیگر کرکترهای فرعی در این انیمه حضور دارند. استودیو A-1 Pictures انیمیشن این بخش را بهتر از قبل و با جزئیات خوبی در هر صحنه طراحی کرده است.